MyISAM vs InnoDB

MySql soporta distintas tecnologías de almacenamiento de datos, entre estas destacan MyISAM e InnoDB, el primero de ellos (MyISAM) es el utilizado por defecto pero en la mayoría de los casos podremos cambiarlo cuando queramos.

Documentación de MySQL sobre InnoDB
Documentación de MySQL sobre MyISAM

InnoDB es una tecnología de almacenamiento de datos de fuente abierta para MySQL, incluido como formato de tabla estándar en todas las distribuciones de MySQL AB a partir de las versiones 4.0. Su característica principal es que soporta transacciones de tipo ACID y bloqueo de registros e integridad referencial. InnoDB ofrece una fiabilidad y consistencia muy superior a MyISAM, la anterior tecnología de tablas de MySQL, si bien el mejor rendimiento de uno u otro formato dependerá de la aplicación específica.

InnoDB (Wikipedia)

MyISAM es la tecnología de almacenamiento de datos usada por defecto por el sistema administrador de bases de datos relacionales MySQL. Este tipo de tablas están basadas en el formato ISAM pero con nuevas extensiones. En las últimas versiones de Mysql, el motor InnoDB está empezando a reemplazar a este tipo de tablas por su capacidad de ejecutar transacciones de tipo ACID y bloqueo de registros e integridad referencial.

MyISAM (Wikipedia)

Ventajas: MyISAM vs InnoDB

InnoDB

• Soporte de transacciones
• Bloqueo de registros
• Nos permite tener las características ACID (Atomicity, Consistency, Isolation and Durability: Atomicidad, Consistencia, Aislamiento y Durabilidad en español), garantizando la integridad de nuestras tablas.
• Es probable que si nuestra aplicación hace un uso elevado de INSERT y UPDATE notemos un aumento de rendimiento con respecto a MyISAM.

MyISAM

• Mayor velocidad en general a la hora de recuperar datos.
• Recomendable para aplicaciones en las que dominan las sentencias SELECT ante los INSERT / UPDATE.
• Ausencia de características de atomicidad ya que no tiene que hacer comprobaciones de la integridad referencial, ni bloquear las tablas para realizar las operaciones, esto nos lleva como los anteriores puntos a una mayor velocidad.

La elección es un tema delicado ya que hay que conseguir la mejor relación de calidad acorde con nuestra aplicación, obviamente si necesitamos transacciones, claves foráneas y bloqueos tendremos que escoger InnoDB por el contrario escogeremos MyISAM en aquellos casos en los que predominen las consultas SELECT a la base de datos (un gran número de páginas webs).